尖锐湿疣在男性患者中通常好发于冠状沟、龟头、包皮、包皮系带、尿道口、尿道内、阴茎体及根部、肛门周围及直肠、腹股沟等处。其中外生殖器和肛门尖锐湿疣是最多见的。肛门和直肠等处的尖锐湿疣主要在男性同性恋当中多见，主要是通过性生活而感染的。
尖锐湿疣常见的损害有丘疹、角化性斑块、乳头样或菜花样赘生物，散在或融合，同一患者常有多种表现。颜色从粉红到灰白色，取决于单个乳头毛细血管的充盈状态。大小不等，质地多数较软。一般患者的主诉可有瘙痒、外伤摩擦后出血、以及大的疣体继发感染后有恶臭。而尿道内尖锐湿疣通常无症状，但脆性损害可引起血尿，很大的疣体则会引起尿路梗阻。
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